细胞器(英语:organelle,或称胞器)是细胞中具有功能的组成部分。在细胞生物学中,细胞器是细胞中拥有特定功能的一个特殊的亚细胞结构。细胞器的名称来源于这些部分就如同身体中的器官一样。细胞器要么被它们自己的生物膜包裹(这类细胞器也称为膜结合细胞器),或者独立存在于细胞之中不被膜包裹(非膜结合细胞器)。虽然大多数细胞器是细胞内的功能单位,但一些延伸到细胞外的功能单位,例如纤毛、鞭毛和古细菌,以及毛囊,通常情况下也被我们称为细胞器。
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